反转录酶的注意事项,随机引物:适合各种RNA的RT,尤其适合模板丰度很低的情况(比如某个gene表达量很低)。选择随机引物时,首先链cDNA合成反应中就是以所有的RNA为模板,然后进行PCR反应时设计引物进行特异性扩增。同时要注意随机引物的量和总RNA量之间的关系,一般建议每5μg总RNA的随机引物的用量为50ng,如果每5μg总RNA的随机引物的用量超过250ng,可能会导致小片段产物(
逆转录是指以RNA为模板合成与其互补的cDNA的过程。逆转录PCR是将RNA的逆转录(reversetranscription)和cDNA的聚合酶链式反应(PCR)相结合的技术,故逆转录称为RT-PCR或反转录PCR。逆转录PCR实验原理是,提取组织或细胞中的总RNA,以RNA为模板,利用逆转录酶反转录成cDNA,再以cDNA链为模板进行PCR扩增,从而获得大量拷贝。逆转录PCR的出现使RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。RNA逆转录实验注意事项:选择合适的引物:随机引物法逆转录产生的片段较小,很难得到全长转录本的cDNA。单独选择某一种引物,实验可能都不...
逆转录实验过程中要注意RNA样品的保存、纯化、处理和转录酶的选择,逆转录实验前要对反应体系进行无RNA和无反转录酶的对照。多逆转录酶都具有多种酶活性,主要包括以下几种活性。①RNA指导的DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。此酶需要RNA为引物,多为色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反转录酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转录酶催化合成的DNA出错率比较高。②RNaseH活性;由反转录酶催化合成的cDNA与模板RNA形成的杂交分子,将由RNaseH从RNA5′端水解掉RNA分子。逆转录PCR反应过程中要注意...
RNA逆转录实验注意事项:防止RNA模板的降解:毫无疑问,RNA质量对cDNA合成结果会产生重要影响。但RNA很脆弱,易于降解。为了保证RNA的完整性,我们需要小心又小心,比如在冰上操作,用RNase-free的头头和离心管,减少操作时间等。在反应体系中加入RNase抑制剂也能有效防止RNA降解。另外,建议在进行逆转录前,通过琼脂糖凝胶电泳检查RNA条带的质量。通常完整的真核RNA应包括28S、18S条带,且28S条带强度一般是18S的两倍左右。RNA逆转录实验注意事项:选择合适的引物:OligodT引物和随机引物都能进行逆转录。OligodT引物只能与mRNA的3’端poly(A)结合,没有...
逆转录酶的合成步骤:1、使用前每个组份轻轻混匀,然后2000rpm离心20s;2、取灭过菌且无核酸酶的0.2ml离心管,依次加入2~5μgRNAnμL;3、65℃保温5min,然后冰浴5min;4、往3步骤中的0.2ml离心管依次加入下列组份:RNase抑制剂(40u/μL)0.5μL、10×M-MLVReactionBuffer2μL、DTT(200mM)1μL、逆转录酶(M-MLV)1μL;5、轻轻混匀后,然后2000rpm离心20s;6、先在37℃保温1hr,然后70℃保温15min;7、上述产物可立即进行下一步的PCR反应或-20℃保存。逆转录酶的质量控制:物理纯度:在SDS-PAGE...
反转录酶(reversetranscriptase,也可写成逆转录酶)又称为依赖RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中发现了一种特殊的DNA聚合酶,该酶以RNA为模板,以dNTP为底物,tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物,在tRNA3'-OH末端上,根据碱基配对的原则,按5'-3'方向合成一条与RNA模板互补的DNA单链,这条DNA单链叫做互补DNA(complementaryDNA,CDNA)。反转录酶(Reversetranscriptase)是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是...
miRNA的加尾法逆转录和qPCR,miRNA加尾法逆转录:增加miRNA逆转录产物长度较直接的方法就是增加miRNA的长度,即在miRNA的3端后面添加一段序列,然后进行逆转录反应。因此,加尾法是由两个酶共同作用完成的,它们分别是PolyA聚合酶和逆转录酶。PolyA聚合酶负责给miRNA加上PolyA尾,增加其长度。之后逆转录引物结合到PolyA序列上,由逆转录酶完成加长版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆转录和qPCR中的qPCR:miRNA荧光定量PCR的过程跟普通mRNA的相似,但由于加尾法逆转录产物的5端均为通用序列,因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R),不同的是根据m...
miRNA的加尾法逆转录和qPCR,miRNA加尾法逆转录:增加miRNA逆转录产物长度较直接的方法就是增加miRNA的长度,即在miRNA的3端后面添加一段序列,然后进行逆转录反应。因此,加尾法是由两个酶共同作用完成的,它们分别是PolyA聚合酶和逆转录酶。PolyA聚合酶负责给miRNA加上PolyA尾,增加其长度。之后逆转录引物结合到PolyA序列上,由逆转录酶完成加长版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆转录和qPCR中的qPCR:miRNA荧光定量PCR的过程跟普通mRNA的相似,但由于加尾法逆转录产物的5端均为通用序列,因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R),不同的是根据m...
反转录酶的注意事项,随机引物:适合各种RNA的RT,尤其适合模板丰度很低的情况(比如某个gene表达量很低)。选择随机引物时,首先链cDNA合成反应中就是以所有的RNA为模板,然后进行PCR反应时设计引物进行特异性扩增。同时要注意随机引物的量和总RNA量之间的关系,一般建议每5μg总RNA的随机引物的用量为50ng,如果每5μg总RNA的随机引物的用量超过250ng,可能会导致小片段产物(
逆转录实验步骤:用SSⅢ逆转录酶进行RT(20ul体积)1、准备0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暂离心。3、65℃水浴5分钟后,立刻0℃冰水浴至少1分钟。4、短暂离心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆转录酶。5、短暂离心。6、50℃水浴60分钟进行逆转录。7、70℃水浴15分钟灭活逆转录酶。8、-20℃保存,或立即进行PCR。MCERTmix含有比例优化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使c...
逆转录引物:加尾法逆转录引物的结构并不是想象中那么简单的oligodT,其包含三个关键结构:①为了与PolyA序列互补配对,OligodT序列必不可少。②在OligodT序列的5端,存在一段通用序列,用于qPCR过程中反向引物与cDNA的结合。③OligodT序列的3端存在一个或两个锚定碱基,V或者VN。(兼并碱基,V表示A、G或C,N表示ATCG中的任意一种)。如果没有锚定碱基,逆转录引物中的OligodT就会随机结合到PolyA的任意位置,这样会造成同一miRNA的逆转录产物长度不一,给较后的熔解曲线检测带来麻烦。因此,锚定碱基的作用就是特异性地结合到miRNA上,从而让逆转录引物结合到紧...
逆转录实验的准备工作:1、实验器具与材料:(1)移液头:200ul、10ul;(2)吸头:200ul、20ul;(3)EP管1。5ml、100ul;(4)水浴箱。2、实验器具的处理与准备,塑料制品:(包括吸头、EP管等)将塑料制品逐个浸泡于1‰DEPC水中(必要时小头头需要用吸管打入DEPC水)37℃过夜,然后送至高压3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小时左右烘干),试验前将头头放入吸头台。3、试剂配制和准备:(1)DEPC水:泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。逆转录中所用的DEPC水的配制:100ml盐水...
逆转录实验的准备工作:1、实验器具与材料:(1)移液头:200ul、10ul;(2)吸头:200ul、20ul;(3)EP管1。5ml、100ul;(4)水浴箱。2、实验器具的处理与准备,塑料制品:(包括吸头、EP管等)将塑料制品逐个浸泡于1‰DEPC水中(必要时小头头需要用吸管打入DEPC水)37℃过夜,然后送至高压3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小时左右烘干),试验前将头头放入吸头台。3、试剂配制和准备:(1)DEPC水:泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。逆转录中所用的DEPC水的配制:100ml盐水...
逆转录酶是存在于RNA病毒体内的依赖RNA的DNA聚合酶。RT-PCR实验中的逆转录酶需要具有以下二种活性:依赖RNA的DNA聚合酶活性:以RNA为模板合成cDNA的首先条链。依赖DNA的DNA聚合酶活性:以一条DNA链为模板合成互补的双链DNA。在选择逆转录酶时,建议选择无RNaseH①活性(RNaseH-)的逆转录酶。具有RNaseH活性的逆转录酶的RNaseH活性会与聚合酶活性竞争RNA模板与DNA引物(或cDNA延伸链)形成的杂合链,并降解杂合链中的RNA链。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作为合成cDNA的有效底物,降低了cDNA合成的产量与长度。逆转录实验前应对所有器具和...
miRNA加尾法及其逆转录是近年来普遍用于miRNA研究的一种技术。它可以帮助我们深入理解miRNA的调控机制,它质量得到改进,效率也得到提高从而为miRNA研究提供了非常重要的资源。未来,miRNA加尾法及其逆转录一定会成为miRNA研究的重要部分,为miRNA研究提供更多有价值的信息。逆转录是一种重要的生物学现象,它在病毒的复制过程中发挥着重要的作用。同时,逆转录还可以作为基因的调节机制,从而控制基因的表达和功能。我们相信,在未来的研究中,逆转录的研究将会取得更多的进展,并且会为治着某些疾病提供更多的帮助。逆转录过程中的缺陷会导致错误扩增和偏差。天津加尾法逆转录酶逆转录酶的质量控制:1.切...
miRNA的加尾法逆转录和qPCR,miRNA与mRNA的在qRT-PCR过程有所不同。一般来讲,mRNA比较长,其长度通常在几百至几千个核苷酸,因此使用随机引物(RandomPrimerp(dN)6)即可随机结合到mRNA的各位置进行逆转录。由于qPCR的过程只需扩增目的片段的一部分(80~200bp),因此使用随机引物的逆转录产物尽管不完整,也完全能够满足qPCR的需求。当然,也可以使用OligodT引物统一从mRNA的ployA尾巴开始逆转录。这种逆转录引物在扩增cDNA全长时是必须的,但要注意,原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾,因此不能使用OligodT引物进行逆...
逆转录是指以RNA为模板合成DNA的过程,即将遗传信息由RNA逆向传给DNA的过程,其遗传的传递方向与转录相反。反转录酶也可写成逆转录酶又称为依赖RNA的DNA聚合酶。是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。RNA指导的DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。此酶需要RNA为引物,多为色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反转录酶中不具有3′→5′外切酶活性,因...
大多数逆转录酶都具有多种酶活性,主要包括以下几种活性。①DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。此酶需要RNA为引物,多为赖氨酸的tRNA,在引物tRNA3'-末端以5'→3'方向合成DNA。反转录酶中不具有3'→5'外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转录酶催化合成的DNA出错率比较高。②RNaseH活性;由反转录酶催化合成的cDNA与模板RNA形成的杂交分子,将由RNaseH从RNA5'端水解掉RNA分子。③DNA指导的DNA聚合酶活性;以反转录合成的首先条DNA单链为模板,以dNTP为底物,再合成第二条DNA分子。质粒RNA检测中的逆转录反应需要特定反应体系。...
逆转录是指以RNA为模板合成DNA的过程,即将遗传信息由RNA逆向传给DNA的过程,其遗传的传递方向与转录相反。反转录酶也可写成逆转录酶又称为依赖RNA的DNA聚合酶。是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。RNA指导的DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。此酶需要RNA为引物,多为色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反转录酶中不具有3′→5′外切酶活性,因...
RNA逆转录实验注意事项:去除基因组DNA污染:残留的基因组DNA(gDNA)会对荧光定量结果造成很大的干扰,为了使结果更加的真实、可重复,我们需要去除gDNA干扰。我们可以在引物设计时避免gDNA的扩增,比如将上下游引物分别设在不同的外显子上;或者在提取RNA后使用DNaseI处理以除去gDNA。较后,我们还有非常法宝,选择一款具有gDNA去除功能的逆转录试剂盒,一步到位去除gDNA,省心省力max。RNA逆转录实验注意事项:逆转录酶热稳定性:逆转录酶在整个反转录体系中具有关键性影响。除了活性以外,逆转录酶的热稳定性同样很重要,在较高温度下进行逆转录,能够减少RNA的二级结构,增加逆转录的效...
逆转录酶实验一步法与两步法具有以下区别:一步法比两步法更快速、简便、减少了污染机会、减少了RNA二级结构、减少了PCR反应的错配率;两步法的优势在于中间产物cDNA,便于保存;且第二步PCR只取逆转录反应产物的1/10进行反应,有利于PCR条件的调整,实验重现性强;两步法可以在第二步PCR反应体系中加入特异性引物,其灵敏度比一步法高;两步法包括首先链cDNA合成和随后的PCR反应,容易产生污染问题;两步法的实验预算要低于一步法。逆转录实验中可以通过qPCR检测逆转录反应效果。成都彩色反转录稳定性高逆转录实验过程中要注意RNA样品的保存、纯化、处理和转录酶的选择,逆转录实验前要对反应体系进行无R...
逆转录的端粒复制:逆转录经常与细胞恶性转化有关,艾滋、乙肝等很多疾病也有逆转录过程。所以相关研究可以为很多疾病的研究和防治提供帮助。逆转录酶抑制剂就一直是药物研发热点,例如抗HIV的nevirapine。逆转录酶缺乏校对(3'-5'核酸外切酶)功能,所以容易出错。这也是很多病毒容易突变进化的原因,比如nevirapine就很容易被抵抗。不过,校对功能与逆转录活性并不矛盾。有人使用改良的定向进化策略从具有校对功能的DNA聚合酶(古细菌的DNA聚合酶B)进化出高保真的耐热逆转录酶,称为逆转录异种聚合酶(reversetranscriptionxenopolymerase),证明校对与逆转录是兼容的...
逆转录酶的合成步骤:1、使用前每个组份轻轻混匀,然后2000rpm离心20s;2、取灭过菌且无核酸酶的0.2ml离心管,依次加入2~5μgRNAnμL;3、65℃保温5min,然后冰浴5min;4、往3步骤中的0.2ml离心管依次加入下列组份:RNase抑制剂(40u/μL)0.5μL、10×M-MLVReactionBuffer2μL、DTT(200mM)1μL、逆转录酶(M-MLV)1μL;5、轻轻混匀后,然后2000rpm离心20s;6、先在37℃保温1hr,然后70℃保温15min;7、上述产物可立即进行下一步的PCR反应或-20℃保存。逆转录酶的质量控制:物理纯度:在SDS-PAGE...
逆转录PCR的用途普遍,可用于分析基因的转录产物、检测细胞中RNA病毒的含量、合成cDNA探针、直接克隆特定基因的cDNA序列等。如在临床上RT-PCR可以用于遗传病诊断、病症检测、检测病人标本中的RNA病毒,如HAV、HCR、HIV等。在植物方面RT-PCR常用于研究环境胁迫对植物基因表达的影响,以及在特定的环境或生长阶段中植物体不同部位基因表达的差异性。使用RT-PCR检测分析RNA转录产物具有以下突出的优点:理论上可以检测几乎任何基因的转录产物;可以实现极为微量RNA样品(ng级别)的检测;样品耐受性好,未经纯化的粗制生物样品也可以用于检测。逆转录PCR是较常用的逆转录应用之一。南京加尾...
逆转录的发现有重要的理论意义和实践意义。(1)在致死病毒的研究中发现了病基因,在人类一些病细胞如膀胱病、小细胞肺病等细胞中,也分离出与病毒病基因相同的碱基序列,称为细胞病基因或原病基因。病基因的发现为疙瘩发病机理的研究提供了很有前途的线索。(2)在实际工作中有助于基因工程的实施。由于目的基因的转录产物易于制备,可将mRNA反向转录形成DNA用以获得目的基因。逆转录酶实验操作注意事项:RNA提取一定要迅速,样本要新鲜,组织尽量在液氮中研磨;RNA提取完马上进行逆转录不要拖延,新提的RNA很容易降解;逆转录反应过程,需建立无RNAase环境,以避免模板RNA降解。RNase是RNA水解酶的统称,包...
RNA逆转录实验注意事项:RNA定量:除了掌握RNA的完整性之外,反转录之前还需要对RNA浓度进行测定。一般反转录试剂盒会对上样量有要求,建议totalRNA上样量小于5μg。超过这个范围,会使反转录产物产生偏好性(表达丰度高的基因优先被反转录)而造成定量结果不准确。逆转录引物的选择:逆转录引物一般包含3种:oligodT引物,随机引物和特异性引物。对于短的且不具备发卡结构的真核细胞mRNA,三种都可用。逆转录实验过程中避免光照,防止RNA样品和试剂受光降解或刺激。逆转录实验中可以通过qPCR检测逆转录反应效果。合肥彩色逆转录试剂RT-PCR逆转录中模板的选择:在RT-PCR实验中,选择总RN...
逆转录的端粒复制:逆转录经常与细胞恶性转化有关,艾滋、乙肝等很多疾病也有逆转录过程。所以相关研究可以为很多疾病的研究和防治提供帮助。逆转录酶抑制剂就一直是药物研发热点,例如抗HIV的nevirapine。逆转录酶缺乏校对(3'-5'核酸外切酶)功能,所以容易出错。这也是很多病毒容易突变进化的原因,比如nevirapine就很容易被抵抗。不过,校对功能与逆转录活性并不矛盾。有人使用改良的定向进化策略从具有校对功能的DNA聚合酶(古细菌的DNA聚合酶B)进化出高保真的耐热逆转录酶,称为逆转录异种聚合酶(reversetranscriptionxenopolymerase),证明校对与逆转录是兼容的...
逆转录的端粒复制:逆转录经常与细胞恶性转化有关,艾滋、乙肝等很多疾病也有逆转录过程。所以相关研究可以为很多疾病的研究和防治提供帮助。逆转录酶抑制剂就一直是药物研发热点,例如抗HIV的nevirapine。逆转录酶缺乏校对(3'-5'核酸外切酶)功能,所以容易出错。这也是很多病毒容易突变进化的原因,比如nevirapine就很容易被抵抗。不过,校对功能与逆转录活性并不矛盾。有人使用改良的定向进化策略从具有校对功能的DNA聚合酶(古细菌的DNA聚合酶B)进化出高保真的耐热逆转录酶,称为逆转录异种聚合酶(reversetranscriptionxenopolymerase),证明校对与逆转录是兼容的...
茎环法逆转录技术具有许多优点。首先,该技术可以在样品数量较少的情况下扩增RNA分子,从而避免了RNA样品的纯化和浓缩操作。其次,茎环法逆转录技术可以特异性地扩增目标RNA分子,避免了随机引物引起的非特异扩增,从而提高了检测的准确性和可靠性。此外,茎环法逆转录技术可以扩增RNA的全长,而不只只是RNA的片段,从而可以更全部地了解RNA的结构和功能。茎环法逆转录技术在分子生物学和医学研究中得到了普遍的应用。例如,在基因表达和调控的研究中,茎环法逆转录技术可以用来研究mRNA的表达模式和在细胞内的分布状态。此外,在病毒学研究中,茎环法逆转录技术可以被用来检测病毒RNA的存在和浓度。在病症诊断和治着中...
miRNA的加尾法逆转录和qPCR,miRNA加尾法逆转录:增加miRNA逆转录产物长度较直接的方法就是增加miRNA的长度,即在miRNA的3端后面添加一段序列,然后进行逆转录反应。因此,加尾法是由两个酶共同作用完成的,它们分别是PolyA聚合酶和逆转录酶。PolyA聚合酶负责给miRNA加上PolyA尾,增加其长度。之后逆转录引物结合到PolyA序列上,由逆转录酶完成加长版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆转录和qPCR中的qPCR:miRNA荧光定量PCR的过程跟普通mRNA的相似,但由于加尾法逆转录产物的5端均为通用序列,因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R),不同的是根据m...