山东蛋白组学如何筛选差异蛋白

来源: 发布时间:2022-07-07

转录组学和蛋白质组学分析作者通过转录组学和蛋白质组学分析暴露于DON的C2C12细胞的差异基因(DEG)。转录组学鉴定了2387个DEG,其中72%被下调。蛋白质组学鉴定出402个DEG,其中74%被下调。GO和KEGG通路富集分析表明,转录组学DEGs参与了“男性主要性征的发育”、“骨骼肌肌球蛋白粗丝组装”和“骨骼肌收缩的调节”等生物学过程。**富集的通路是“ECM-受体相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白质消化吸收”。蛋白质组学分析中,富集到了“肌肉收缩”、“中间丝解聚”和“脂质转运”等生物学过程。细胞成分中富集到“细胞骨架”、“细胞外基质”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和庆大霉素生物合成”、“系统性红斑狼疮”、“ECM-受体相互作用”和“蛋白质消化和吸收”。前两条通路与上调的DEG相关,而后两条通路与下调的DEG相关,这与转录组学结果一致。一站式服务,研究不同生物体在不同时刻/状态下蛋白质表达的变化。山东蛋白组学如何筛选差异蛋白

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蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学研究案例:2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文,通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*(iCCA)患者的配对**和*旁组织进行了分析,通过绘制肝内胆管*的多维分子图谱为进一步鉴定iCCA的分子发病机制、分子分型、预后等提供了宝贵的资源。北京蛋白组学高通量修饰蛋白质组试-蛋白质组学 解决方案。

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本研究通过生理和蛋白质组学分析在冬油菜中鉴定了大量的冷胁迫响应蛋白。探讨了冬油菜耐冻性增强的机理和低温胁迫对冬油菜形态和生理生化变化的影响。文章以耐冻型Longyou 7和冷敏感型Lenox为材料,通过iTRAQ标记蛋白组学和转录组学分析,揭示了谷胱甘肽转移酶活性、碳水化合物结合和谷胱甘肽结合、代谢过程及IAA反应与冷应激反应密切相关,鉴定出了Longyou 7和Lenox之间的DAPs,这些DAPs参与氨基酸、碳水化合物、脂质和能量代谢,对提高冬油菜的耐冻性发挥了重要作用。

蛋白质是生命活动的主要执行者,而蛋白质磷酸化修饰是生物体内**重要的共价修饰方式之一,真核生物体内有超过三分之一的蛋白可以发生磷酸化修饰。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程调节着包括细胞增殖、发育、分化、信号转导、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩及**发生等过程在内的所有生命活动。单一的磷酸化蛋白质组学只能解释蛋白磷酸化水平发生的变化,而[黄金搭档]——蛋白质组与磷酸化蛋白质组联合分析,则在揭示疾病相关特性、筛选疾病生物标志物、寻找药物靶点等方面发挥了更加重要的作用。欧易鹿明生物基于质谱技术,生物信息学方法,提供蛋白质组学。

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蛋白质是生命功能的直接体现者,近几年来,蛋白质组研究越来越多的体现在多种疾病机理的阐明,为科研问题攻克提供理论根据和解决途径。通过蛋白质组比较分析,找到特异性的蛋白,成为新药物设计的分子靶点,为疾病的早期诊断提供分子标志。然而生物体内的蛋白组学是一个非常复杂的体系。近几年来,由于质谱技术的发展,让我们对生物体内蛋白组的认识更加***和准确。尤其基于TimsTOF Pro系列质谱仪,被称为4D蛋白组学技术为蛋白组学提供全新的覆盖深度和通量,为精细医疗提供**技术支持力量。欧易生物、鹿明生物助力您的4D蛋白组学研究。修饰蛋白质组试剂及服务,蛋白质组学解决方案。辽宁蛋白组学四代

蛋白质组学的特点蛋白质组和蛋白质组学的概念。山东蛋白组学如何筛选差异蛋白

iTRAQ标记定量蛋白组学研究方法:2021年4月,南京林业大学喻方圆教授(一作:吴岐奎)课题组在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊发表了题为“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,通过转录组学+iTRAQ标记定量蛋白组学研究方法,分析东京野茉莉种子发育过程中脂肪酸生物合成相关基因的表达趋势,确定油脂积累的主要影响因子并构建其调控网络。为野茉莉属植物种子油用研究和后续功能分析研究提供了一定的研究基础。山东蛋白组学如何筛选差异蛋白

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