上海代谢组学的数据处理

来源: 发布时间:2022-12-01

非靶向代谢组学研究:利用番茄的自然变异确定番茄复合体中果实多酚的途径结构和代谢调控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究对象:番茄组织发表期刊:MolecularPlant影响因子:13.164组学技术:LC-MS靶向代谢组学、GC-MS非靶代谢组(双平台代谢组学),本研究通过表征构成八种不同番茄多酚代谢网络的潜在生物合成和修饰反应,阐明了八种番茄复合体多酚生物合成的整个生物合成框架,并对相关代谢物和结构基因进行了详细注释,并运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学方法为辅助育种提供帮助。此外,番茄果实成熟过程中的代谢变化为今后基于遗传的代谢工程设计提供了研究方向,并为研究其他重要植物物种中特定的代谢物的功能提供了理论依据。氨基酸代谢组学,胆汁酸代谢,脂肪酸代谢,神经递质代谢,花生四烯酸代谢。上海代谢组学的数据处理

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非靶代谢组学、靶向代谢组学技术研究,2021年9月暨南大学白卫滨课题组在Food Chemistry发表了题为 “Pyruvic acid stress caused color attenuation by interfering with anthocyanins metabolism during alcoholic fermentation”的研究成果,通过非靶代谢组学、靶向代谢组学等技术研究**酸胁迫对葡萄酒品质的影响,发现**酸过量会干扰酒精发酵过程中花青素的代谢,从而影响葡萄酒色泽。中文标题:**酸胁迫通过干扰酒精发酵过程中的花青素代谢导致葡萄酒颜色变浅研究对象:葡萄、酵母菌发表期刊:FoodChemistry影响因子:7.514发表时间:2021年9月28日合作单位:暨南大学运用生物技术:非靶代谢组学、靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)北京代谢组学 定量代谢组学研究技术与应用、代谢组学数据库。

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**靶向代谢组学研究,中文标题:代谢组学分析揭示了COVID-19新的发展特征研究对象:****患者发表期刊:EuropeanRespiratoryJournal影响因子:16.671发表时间:2021.7.21运用生物技术:LC-MS非靶代谢组学+靶向代谢组学,****已经***了1.6亿多人,并导致全世界数以百万的人死亡;至少部分原因是它的病理生理尚不清楚。所以,识别****的潜在分子机制对于战胜**是至关重要的。此外,代谢物通过在疾病进展过程中获得***的病理生理学意义来反映个体的疾病进展。因此,中国广州多家研究机构的科研人员使用了非靶向和靶向代谢组学分析对****患者所有阶段血清的代谢特征进行了***的观察。与健康对照组比较,在发现队列和验证队列中,轻度、重度和恢复期循环代谢物的变化模式不同,提示糖代谢和尿素循环的代谢重编程是****进展的潜在病理机制。

代谢组学研究,2021年12月威尔康奈尔医学中心和纪念斯隆凯特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授课题组在Nature Communications期刊发表的题为 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通过蛋白质组学和代谢组学研究方法,发现了高度转移性 SOX2/OCT4+ 细胞的离散亚群表现出细胞内铜水平升高特征,探究了TM 介导的复合物 IV 失活确定为 SOX2/OCT4+ 细胞群中的主要代谢缺陷,AMPK/mTORC1 能量传感器为重要的下游途径。描绘了铜-代谢-转移轴,为高风险三阴性乳腺*患者的下一代治疗方法提供了理论依据。代谢组学——后基因组时代新热点。

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代谢组学研究:浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展,作者:杨桂玲,王彦华,李健,王豆,鲍志伟,王强(通讯作者),靳远详(共同通讯作者),在Journal of Hazardous Materials期刊发表了题为“Health risks of chlorothalonil, carbendazim, prochloraz, their binary and ternary mixtures on embryonic and larval zebrafish based on metabolomics analysis”的研究成果,通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。代谢组学-对生物体内所有代谢物进行定量分析。上海代谢组学 和 脂质代谢组学

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LC-MS非靶向代谢组学,中文标题:TNT、RDX、HMX(三种物)在苜蓿中的生物降解和植物毒性机制分析研究对象:苜蓿根发表期刊:Chemosphere影响因子:7.086发表时间:2021.05.18合作单位:西南科技大学运用关键技术:LC-MS非靶向代谢组学文章中LC-MS非靶向代谢组学由欧易/鹿明生物提供技术支持2021年5月,西南科技大学罗学刚教授团队在Chemosphere期刊发表的研究成果,通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法,探索了物暴露对植物的毒性机制,验证了植物体内被降解的TNT、RDX和HMX残留物和中间产物干扰植物正常生理代谢的假设。描绘了在三种物影响下苜蓿代谢组图谱,为环境污染物毒理学研究提供了新思路和方法。上海代谢组学的数据处理

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