深圳茎环法逆转录

逆转录常见问题及解决方法之组织提取：RNAisolater可以提取miRNA吗?可以提取miRNA。他普遍适用于培养细胞、动物组织、微生物以及代谢较少的植物组织，如幼苗、幼叶等。提取的RNA有基因组DNA污染：a)、向裂解液中加入氯仿后，需要在低温下(2-8°C)高速离心。离心后，RNA被抽提到上层的水相中，中、下层是有机相，含有氯仿。DNA即存在于中层。氯仿在常温下会与水以一定比例互溶，因此，常温离心会导致上层水相中也有少量基因组DNA污染。吸取上层液体时，应非常小心，避免吸到中间层和下层，为此失去一点得率，保留一些上清不吸是非常值得的。RNA应如何保存：建议分装后在-80℃长期保存，在-20℃可以短期保存，但需要尽快使用。逆转录酶还有DNA内切酶活性，这可能与病毒基因整合到宿主细胞染色体DNA中有关。深圳茎环法逆转录

miRNA的加尾法逆转录和qPCR，miRNA加尾法逆转录：增加miRNA逆转录产物长度较直接的方法就是增加miRNA的长度，即在miRNA的3端后面添加一段序列，然后进行逆转录反应。因此，加尾法是由两个酶共同作用完成的，它们分别是PolyA聚合酶和逆转录酶。PolyA聚合酶负责给miRNA加上PolyA尾，增加其长度。之后逆转录引物结合到PolyA序列上，由逆转录酶完成加长版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆转录和qPCR中的qPCR：miRNA荧光定量PCR的过程跟普通mRNA的相似，但由于加尾法逆转录产物的5端均为通用序列，因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R)，不同的是根据miRNA序列设计的正向引物。正向引物的特异性就变得非常重要。对于内参，生工生物的miRNA加尾法首先链cDNA合成试剂盒(B532451)中内置了内参U6的正向引物，使用该引物与通用引物R即可进行内参U6的扩增。cDNA合成逆转录报价逆转录的反应机理是RNA模板上的DNA合成。

逆转录过程由逆转录酶催化，此酶也称依赖RNA的DNA聚合酶（RDDP），即以RNA为模板催化DNA链的合成。合成的DNA链称为与RNA互补DNA（complementaryDNA,cDNA）。逆转录酶在生物界存在于逆转录病毒以及真核细胞（如端粒酶）中，拟逆转录病毒没有单独的逆转录酶，其DNA聚合酶带有逆转录酶的活性，可能与病毒的恶性转化有关。人类免疫缺陷病毒（HIV）就是一种逆转录病毒，含有逆转录酶。在小鼠及人的正常细胞和胚胎细胞中也有逆转录酶，例如端粒酶就是一种逆转录酶，推测可能与细胞分化和胚胎发育有关。

逆转录实验的准备工作：1、实验器具与材料：（1）移液头：200ul、10ul；（2）吸头：200ul、20ul；（3）EP管1。5ml、100ul；（4）水浴箱。2、实验器具的处理与准备，塑料制品：（包括吸头、EP管等）将塑料制品逐个浸泡于1‰DEPC水中（必要时小头头需要用吸管打入DEPC水）37℃过夜，然后送至高压3次，后在80℃烘烤箱中烘干（或置于37℃中8小时左右烘干），试验前将头头放入吸头台。3、试剂配制和准备：（1）DEPC水：泡实验器具的DEPC水的配制：1000ml双蒸水中加1mlDEPC，放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。逆转录中所用的DEPC水的配制：100ml盐水瓶内装40ml双蒸水，加40ulDEPC，37℃过夜，送至高压，后分装到几个1。5mlEP管中，-20℃中保存备用。（2）RT中所需要的各种试剂。逆转录实验中可以通过qPCR检测逆转录反应效果。

反转录酶(reversetranscriptase,也可写成逆转录酶)又称为依赖RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中发现了一种特殊的DNA聚合酶，该酶以RNA为模板，以dNTP为底物，tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物，在tRNA3'-OH末端上，根据碱基配对的原则，按5'-3'方向合成一条与RNA模板互补的DNA单链，这条DNA单链叫做互补DNA(complementaryDNA，CDNA)。反转录酶（Reversetranscriptase）是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA（cDNA）的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。逆转录在研究RNA表达调控等领域有普遍的应用前景。深圳茎环法逆转录

酵母菌逆转录酶是逆转录酶家族中的一个重要表示。深圳茎环法逆转录

逆转录酶实验流程：从细胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆转录酶、引物、dNTPs的反应体系中→退火，引物与RNA链配对→延伸，逆转录酶合成互补cDNA链变性→常规PCR反应流程（变性、退火、延伸，如此多次循环）。RT-PCR“两步法”与“一步法”RT-PCR的实验操作分为“一步法”与“两步法”两种。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需构建cDNA文库（即cDNA合成与PCR反应在同一Buffer及酶中进行，一步法完成），省略了cDNA与PCR之间的过程。两步法RT-PCR首先用反转录酶合成cDNA，然后以cDNA为模板进行PCR，即RNA反转录与PCR扩增分两步进行。深圳茎环法逆转录