陕西QuantSeq FWD UMI第二连合成模块Lexogen试剂盒代理

来源: 发布时间:2021-04-23

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品设计模块化概念:Spike-InRNA对照质控品有两个模块,即isoform模块和ERCC模块,每个模块用于特定的研究场景。Isoform模块SIRVisoform模块以“**浓缩”方式模拟转录组的复杂性,它包括来自7个人类模型基因的69个人工可变剪切转录本组成。该模块***反映了可变剪接、可变转录起始和终止位点、重叠基因和反义转录的变化。每个模型基因有6到18个可变转录本,isoform的复杂性非常高,可以对RNASeq工作流程进行深入的探测1。为不同转录本的注释流程提供了正确的以及(示例性的)不充分和过度的注释2。SIRVisoform模块有三种,MixE0(所有的SIRV转录本等摩尔比例混合),E1(不同转录本拷贝数之间差异可高达8倍),E2(不同转录本拷贝数之间的差异可高达128倍)。ERCC模块ExternalRNAControlsConsortium(ERCC),由92个人工转录本组成,且无重叠序列。由于其序列的独特性,在不考虑isoform的情况下,适用于技术参数的评估。ERCCMix1覆盖220(106)的动态范围,可解决整个表达谱转录本丰度的复杂性问题3,4。将指定和评估的reads与已知浓度进行比较,可以评估动态范围、响应剂量、检测下限和工作流程的有效性。 Lexogen试剂盒的主要特点有很多。陕西QuantSeq FWD UMI第二连合成模块Lexogen试剂盒代理

Lexogen试剂盒

RiboCoprRNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠):总RNA中包含大量核糖体RNA(rRNA),通常科研人员对这些rRNA不感兴趣。Lexogen公司的RiboCoprRNA去除试剂盒可以高效地从完整的或降解的大鼠、小鼠和人类总RNA样本中去除rRNA。去除rRNA后的RNA样本可以用于二代测序(NGS),或其它需求的RNA分析应用。产品优势:高度特异性去除(高达%)人类、小鼠、大鼠RNA样本中的细胞质rRNA(28S、18S、、5S、45S)和线粒体rRNA(mt16S、mt12S);适用于完整高质量的或降解的RNA(如FFPE样本);灵活的RNAinput量(1ng-1μg的总RNAinput量);自动化友好的操作流程—基于磁珠纯化流程;简单稳定的工作流程—无酶促反应和机械剪切步骤;可以与任何RNA-seq文库构建试剂盒无缝对接(包括Lexogen公司的CORALLTotalRNA-Seq);NEW!流程更快:(包括20min的手动操作时间)。工作流程:亲和探针和总RNA(1ng–1μg)一起混合并变性,促进探针结合靶标序列。然后,在高温下进行RNA和探针的杂交,同时,rRNA去除磁珠可以从溶液中除去探针和杂交的核糖体RNA。***用磁珠纯化剩余的RNA完成整个过程。整个流程通过使用磁珠达到rRNA的***和纯化的目的,便于实现自动化操作,并可在2小时内快速、便捷的除去rRNA。 陕西QuantSeq FWD UMI第二连合成模块Lexogen试剂盒代理云生物主营产品包括Lexogen试剂盒,批发价格优惠。

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    RiboCoprRNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠)性能表现:RiboCop可高效地去除人类、大鼠和小鼠RNA样本中的rRNA(高达)。即使是高度降解的样本如FFPE(第3列),同样可以用RiboCop去除rRNA。通常回收率为RNAinput量的1-3%,同时高度取决于input的材料。此外,RiboCop的重复性极好。对于input量为100ng或10ng的UHRR样本,重复结果的相关性R2分别为。Lexogen的RiboCoprRNA去除试剂盒%的rRNA去除效率。RiboCop去除rRNA后,建库并在HiSeq仪器上测序。测序结果与rRNA参考序列比对,并以对应的未***rRNA的文库为参考进行定量。表格中的数据为100ng总RNA每反应的input量。UHRR—通用的人类参考RNA;HBRR—人类大脑参考RNA;mtrRNA—线粒体rRNA。

    Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒QuantSeq-Pool与Quantseq结果高度一致。QuantSeq-Pool可获得与Quantseq一致的结果,两者有良好相关性,且重复性好。轻微的差异主要体现在mt转录本上,这主要是由于Quantseqpool和Quangtseq操作流程上的差异导致,如对于低input,10ng的RNAinput量,Quantseq需要使用低input的操作流程。QuantSeq-Pool结合了样本barcode标记和早期pooling与3'mRNASeq的优点,是一种节省时间、测序数据量和数据分析工作的基因表达谱分析方法。这意味着与传统的mRNA-Seq项目相比,总成本降低了10倍。input量通常可以低至10ng总RNA,内置的UMIs可以消除PCR带来的偏好性,从而实现高度可信、稳定的基因表达分析。便捷的操作流程可以手动进行高通量量处理样本,而且对于需要大规模混样测序的项目也可用自动化操作流程。 一个好的Lexogen试剂盒需要具备哪些特点您了解吗?

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industryTemplate使用Lexogen试剂盒的好处您了解多少呢?陕西QuantSeq FWD UMI第二连合成模块Lexogen试剂盒代理

云生物专业致力于Lexogen试剂盒维修。陕西QuantSeq FWD UMI第二连合成模块Lexogen试剂盒代理

Quant-seq表达谱文库构建试剂盒建库流程:QuantSeq 表达谱建库试剂盒通过oligo dT引物特异逆转录poly(A)尾3’mRNA,第二链使用随机引物进行合成。由于插入片段的大小是由第二链合成引物和poly(A)尾之间的距离决定的,因此无需额外进行 RN**段化。随后的PCR可以提供9,216个不同的i5/i7index组合用于Illumina平台,48个index 用于Ion Torrent平台。能够实现更多样本混样测序。Lexogen提供两个版本的Illumina Quantseq 表达谱建库试剂盒,不同处在于Illumina接头序列的位置。下图绿色的是Read 1的序列,蓝色的是Read 2的序列。QuantSeq Forward (FWD) 在第二链合成的引物中包含Read 1 序列。因此,测序的方向是朝向poly(A)尾的方向。推荐使用这种方法进行基因表达的分析。如果研究关注的是转录的3’端序列或者双端测序策略,推荐使用QuantSeq Reverse (REV),Read 1 接头序列由oligo(dT)引物引入。陕西QuantSeq FWD UMI第二连合成模块Lexogen试剂盒代理