江苏LUTHOR单细胞建库试剂盒Lexogen试剂盒代理价格

来源: 发布时间:2021-04-29

    SLAM-ITseq:确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达:对于该应用,将4-Thiouracil(不是SLAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNAseq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushimaetal.,2018)。SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM-ITseq数据兼容,可对其进行分析。 云生物主营产品包括Lexogen试剂盒。江苏LUTHOR单细胞建库试剂盒Lexogen试剂盒代理价格

Lexogen试剂盒

PCR Add-on Kit for Ion Torrent:PCR Add-on试剂盒包含PCR Mix,PCR Mix中包括Ion Torrent特异性引物和热稳定聚合酶。使用PCR Add-on试剂盒,可以做更多的PCR来确定合适的循环数,防止文库不足或过量。如果样品PCR循环数不够(文库量不够),则该试剂盒可用于增加PCR循环数,重新放大文库。

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    SLAMseq代谢标记试剂盒产品应用测量RNA合成及降解速率:用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析。RNA的周转速率决定了整个转录组。图2显示了两个基因的合成与降解典型动力学实验数据。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。新转录RNA及总RNA差异表达谱并行分析SLAMseq可以从同一个样本中同时分析总RNA及新转录RNA的表达。为阐明标准RNA测序,稳态RNA-seq以及基于SLAMseq的代谢RNA测序之间的差异,Muhar等人在人细胞系中做了基因差异表达分析(Muharetal.,2018)。SLAMseq可***提高基因差异表达检测和定量的灵敏度()。SLAMseq可分析新合成mRNA水平来揭示抑制剂处理对转录的反应,而标准RNA-Seq却不行。因此,SLAMseq是揭示细胞反应潜在机制和药物发现研究的理想选择。

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:作为强有力的转录组分析工具,RNA测序已经被应用到众多研究项目中,并且很有希望将其应用范围进一步扩展到诊断与***领域中。为保证分析的有效性,实验室测试必须提供可重复性和稳定性俱佳的精细信息。Makers和质控品是**可以准确无误的判定实验可靠性的方式。Lexogen公司研发的SIRVs可以评估转录组测序实验的质量和数据可比性。产品优势:通用的标准品,用于比较分析和监控整个RNA测序实验;验证RNA测序流程,发现测序错误的来源和偏差,改善RNA测序从建库到数据分析的整个流程;兼容所有的测序平台,各种生物来源的RNA,甚至单细胞水平的RNA;通过综合设计,*****isoform和转录组丰度的复杂性;提供三套不同的标准品(SIRV1,2,3),适用于复杂的isoform表达分析以及简单的样品之间的比较。工作流程:Spike-InRNAVariant(SIRV)对照质控品是人工转录本,*****了转录组的复杂性,实验过程中将其掺入样品(匀浆组织/细胞或纯化的RNA)中,标准品的数据量占总reads数的1-2%。通过SIRV的数据分析,可以评估RNA测序过程的精度和准确性,以确定每个处理样本的技术噪音。然后根据质量评测和偏差系数来计算实验之间的一致性。 云生物销售的Lexogen试剂盒拥有完善的售后服务。

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    RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:Lexogen的RiboCop细菌核糖体RNA去除试剂盒基于磁珠捕获(无酶促反应),自动化友好的工作流程去除细菌总RNA中的rRNA。RiboCopinput范围宽泛(1ng-1μg),适用于完整的及降解的RNA。针对革兰氏阴性、革兰氏阳性和混合细菌种类进行优化的探针设计以确保转录组结果的无偏差(无脱靶效应),同时有效地去除23S、16S和5SrRNA。细菌中rRNA的含量可高达98%,对于细菌转录组分析来说具有一定的挑战性,特别是在分析复杂细菌群落的转录组时,难度更大。Lexogen的RiboCoprRNA去除试剂盒可有效地从混合细菌样品或单一菌株中去除23S、16S和5SrRNA。兼容完整的以及降解的RNA样本,工作流程简单、高效。rRNA去除后的RNA样品适用于NGS文库的制备及类似的应用,为细菌转录组组成提供一个***的分析方案。RiboCop通过杂交捕获去除不需要的rRNA:RiboCop采用一套亲和探针,可从完整的及降解的RNA中特异和高效地去除rRNA序列。Lexogen精密的探针设计**限度地减少了可能导致NGS数据发生偏差的脱靶效应。Input量可低至1ng,高至1μg的总RNA,取决于样品组成和使用的产品类型。rRNA去除试剂盒中**的探针池可用于革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌。 云生物销售的Lexogen试剂盒质量很好。江苏LUTHOR单细胞建库试剂盒Lexogen试剂盒代理价格

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    SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAMseq试剂盒从S4U标记条件的优化到进行S4U标记动力学实验,以及后续的RNA提取和烷基化,SLAMseq试剂盒为RNA代谢测序实验提供了一个完整的解决方案。产品应用:测定RNA合成及降解速率用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析,测定整个转录组的RNA周转率。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。 江苏LUTHOR单细胞建库试剂盒Lexogen试剂盒代理价格